获得攀瀑技能后，米可利会离开现场，此时就能正式挑战水系道馆了。整个过程需要严格按照唤醒神兽、平息冲突、获得技能的顺序完成前置条件。
Pokemmo丰源地区最后一个水系道馆入口在哪
接下来到绿岭市向下冲浪到127号水路，使用潜水技能在水下发现隐藏洞穴。进入洞穴找到潜水艇，上浮后又发现新洞穴，触发剧情击败水舰队老大，海皇牙随即逃离现场。
抵达水系道馆所在地琉璃岛时，会目击海皇牙与古拉顿的激战。此时先去找大吾，再去琉璃岛上方的觉醒寺找米可利，他指引你前往天空之柱获取关键道具。
首先需要完成七个道馆挑战，然后通过特定剧情唤醒海皇牙和古拉顿。先去送神火山山顶找到火岩队之证，接着坐缆车前往烟突山中部洞穴，打败火岩队老大后古拉顿会逃走。
在天空之柱顶层会遇到裂空座，它会突然飞离现场。回到琉璃岛发现裂空座已经平息了两只神兽的冲突，这时需要先和火岩队、水舰队首领对话，再找米可利获得攀瀑技能。