还有一种地质学猜测认为，老爷庙水域地下石灰岩易溶，可能形成大型溶洞群及暗河。在恶劣气候产生龙卷风导致湖水漩涡时，船只可能被吸入地下溶洞。专家进一步推测，即便有溶洞，也被厚厚的砂层覆盖，当砂层下积水释放冲破砂层时，不仅会翻掉船只，还会用下沉的沙子掩埋沉船，导致遗骸和物品难以寻找，真相仍有待进一步科学考察揭开。
鄱阳湖有哪些未解之谜？
关于沉船谜团，起初有观点认为是大型水生生物如大鱼或江豚掀翻船只，但这无法解释几十吨甚至上千吨船舶被翻的情况。近年来，气象科技人员在老爷庙附近设立观测站发现，这里是鄱阳湖乃至江西省的一个少有大风区，最大风力可达16级，风速每小时200公里，全年平均每两天就有一天风力达到6级，狂风怒吼形成的巨大冲击力可能导致船毁人亡。
虽然老爷庙水域沉船无数，甚至据说埋葬了许多财宝，但中科院研究员姜加虎指出一个不可思议的现象：湖底多次考察均未发现沉船遗物或遇难者遗骸，总是人船俱失，毫无踪迹。这种异常的“消失”现象，加上侵华日军“神户丸号”运输船在此悄无声息沉没且潜水员精神失常等离奇事件，更增添了这里的神秘色彩。
鄱阳湖老爷庙水域之所以被称为“中国百慕大”，是因为这里千百年来神秘失踪的船只不计其数，连载重2000多吨的大船也曾在此沉没。据江西省九江市海事部门及都昌县志记载，仅在1985年8月3日一天，就有13艘船只接连失事，这种罕见的密集沉船现象让这片位于江西都昌县湖东岸的水域成为了一个未解之谜。
除了气象因素，复杂的水文条件也被视为重要原因。老爷庙水域全长24公里，最窄处仅3公里，几股强大水流在此交汇，流速从南湖开阔处的0.3米/秒以下骤增至1.54～2米/秒，并在主槽产生涡流，增加了危险性。此外，红外航空照片显示湖底存在一个长约2公里的巨大沙坝，可能阻挡水流形成致命漩涡，尽管这仍不能完美解释人船俱失的现象。