初中看过的矮个子主角会武功搞笑足球动漫是哪部？

你找的应该是《神通少年》或者它的续作《反斗前锋》，我初中那会儿也看过这套漫画，剧情真的特别逗，主角设定是从香港回来学功夫的，踢足球的时候动作招式都带着武打的风格，非常符合你说的会武功的印象。