2008年费德勒又一次打进法网决赛，前六场比赛虽有三场四盘大战，但他仍掌握胜利。然而在决赛中，面对此前连续击败自己的纳达尔，费德勒经历了职业生涯最惨痛的一次失败，以1-6、3-6、0-6完败。
费德勒在法国网球公开赛的历年参赛成绩
2007年纳达尔在红土上展现出绝对统治力，费德勒的法网之梦依旧艰难。虽然在汉堡大师赛上他击败了纳达尔，但在法网决赛中，面对纳达尔坚强的神经，费德勒再度遗憾告负，比分分别为3-6、6-4、3-6、4-6。
2011年法网，费德勒在半决赛中凭借顽强斗志和强势进攻，以7-6(5)/6-3/3-6/7-6(5)击败了当时41连胜的德约科维奇，自去年澳网后再次打进大满贯决赛。遗憾的是，在决赛中他苦战四盘不敌纳达尔，再次与冠军失之交臂。
2010年法网，费德勒以头号种子身份出战，却在先胜一盘的有利情况下被逆转。他以6-3、3-6、5-7和4-6不敌瑞典选手索德林，连续第23次杀入大满贯单打四强的纪录就此终结。这也是他职业生涯首次不敌索德林，后者终结了对费德勒的12连败。
到了2001年，费德勒再次遭遇了克雷特加，但这次他的表现有了很大提升，成功杀进了八强。在1/4决赛的争夺中，他最终以5-7、4-6、5-7的比分惨遭淘汰，但这依然取得了他当时征战法网以来的最佳成绩。
2004年的费德勒在前两轮展现了完美的表现，连闯两关且不失一盘进入32强。但在第三轮，他遇到了法网三冠王库尔腾，最终连输三盘，爆了个不大不小的冷门，止步于此。
2006年费德勒一路高歌猛进，半决赛中纳尔班迪安中途伤退更为他节省了体力。但在决赛中面对纳达尔，虽然第一盘他以6-1拿下气势如宏，随后纳达尔连拿两盘反超。第四盘进入抢七，费德勒未能将比赛拖进决胜盘，这场失利也是他第一次在大满贯决赛中输球。
2005年法网是费德勒突破的一年，前五轮五场比赛他未失一盘，展现了强大的实力。即便击败冈萨雷斯和莫亚这样的红土好手也显得游刃有余。虽然在半决赛中他以3-6、6-4、4-6、3-6失利于纳达尔，但进入四强已是当时他创造的最佳成绩。
2000年法网，费德勒表现出色地闯进了十六强。不过在争夺八强席位的比赛中，他面对西班牙红土好手克雷特加，因为不够耐心而输掉了比赛，三盘比分分别是5-7、6-7（7）和2-6。对于这一年来说，能前进三轮已经是一个不错的成绩了。
费德勒在1999年法网的首秀中，面对的是当时已经是美网两冠王的澳大利亚名将拉夫特。虽然年轻的费德勒在先赢一盘的情况下，最终还是以1-3的比分告负，四盘比分分别为7-5、3-6、0-6和2-6，但这标志着他法网征程的开始。
2002年费德勒的状态出现起伏，尽管他在法网之前的热身赛——汉堡大师赛上拿到了个人的第一个大师赛冠军。然而来到罗兰-加洛斯后，他在首轮遭遇阿拉兹时大失水准，送出了无数的受迫性失误，最终止步于首轮。
2003年法网前，费德勒在马赛、迪拜和慕尼黑豪取三个冠军，状态正佳。但红土场似乎并不属于他，首轮对阵名不见经传的秘鲁人霍纳时，他输得莫名其妙。最终比分6-7（6）、2-6，还有一个6-7（3），费德勒竟遭横扫出局。
2009年是费德勒的高光时刻，他终于实现了全满贯梦想。作为第十九次闯进大满贯决赛的他，虽未与纳达尔直接交锋，但冠军实至名归。他在比赛中多次逆转取胜，八强战直落三盘，半决赛再次逆转，决赛迎战索德林时更是3-0捧杯，赢得了梦寐以求的法网奖杯。