在《深海迷航》这款游戏中，总共存在五种不同的潜艇供玩家探索和使用。这五种潜艇分别是魔鬼鱼号、独眼巨人号、天龙座号、海蛾号以及海王星号。魔鬼鱼号、独眼巨人号、天龙座号和海蛾号是玩家在探索海洋行星4546B过程中可以驾驶的主要潜水载具。其中海蛾号还有小型和大型版本的区别，为玩家提供了不同层级的探索能力。而海王星号则具有特殊的意义，它不仅是游戏中后期的重要载具，更是玩家最终逃离这颗危险星球的关键工具。玩家需要建造并搭乘海王星号逃逸火箭，才能最终返回地球。这些潜艇的设计背景与游戏的主线剧情紧密相关。游戏设定在22世纪晚期，玩家扮演的次级系统维护官Ryley Robinson在阿尔特拉远途采矿船极光号坠毁后，需要在海洋中生存并探索真相。
