尼摩艇长向教授展示了潜艇内部的豪华设施，包括藏有一万两千册书的图书室、用海带制成的雪茄以及他收集的精美标本。他详细解释了潜艇的动力来源、空气制造方法以及电力系统的运作原理，并介绍了附属小艇的用途。这一切都基于一种当时人类尚未完全掌握的先进科技，让教授惊叹不已。
《海底两万里》经历了哪些事件？
教授和同伴们最终被罗佛丹群岛的渔民救起。至于尼摩艇长和鹦鹉螺号的最终下落，则成了一个未解之谜，消失在深海漩涡之中。这段充满冒险、科学幻想与人性探讨的海底之旅，至此落下帷幕。
林肯号与“独角鲸”展开了激烈的追逐战，但对方似乎是在捉迷藏。最终，当林肯号发起进攻时，怪物突然熄灭灯光并向其喷射大水，导致林肯号遭受重创。阿罗纳克斯教授和孔塞伊落入海中，就在他们筋疲力尽即将沉没时，被躲在怪物背上的内德·兰德拉出水面，并震惊地发现这怪物竟是钢制的潜水艇。
在返回潜艇途中，他们遭遇了巴布亚土著人的围攻。尼摩艇长利用通电的艇外壳击退了土著人，并精准地利用潮汐让潜艇脱离险境。在印度洋航行时，尼摩艇长测量海水温度，发现深层海水恒温。随后，他因某些原因突然将三人关押并强制睡眠，次日才带他们前往珊瑚王国，为一位去世的艇员举行海葬。
这次行动由法拉格特舰长指挥，教授带着他不假思索跟随的仆人孔塞伊一同出发。然而，舰上只有一位加拿大捕鲸手内德·兰德对独角鲸的存在表示怀疑，其他人则同仇敌忾。在太平洋游弋了半年后，船员们几近泄气要求返航，但在最后期限的时刻，内德·兰德终于发现了那个目标。
在地中海底部，教授看到了许多遇难船只的残骸，景象惨不忍睹。在维哥湾，内德·兰德再次怂恿教授逃跑，但潜艇却停了下来。尼摩艇长讲述了1702年西班牙沉船的历史，并指挥手下潜水搬运沉船上的金银珍宝，以此作为对陆地势力的某种反抗。
海底探险正式拉开帷幕，潜艇在海面下50米处穿越黑潮流。教授和同伴们穿戴装备，在尼摩艇长的带领下漫步海底平原，欣赏形态各异的海洋生物。他们甚至进入海底森林打猎，在克雷斯波岛的绝壁下遇到了巨型海蜘蛛和海獭，并惊险地躲过了角鲨的袭击，在那里度过了几个钟头的静谧时光。
在南大西洋海域，教授看到长须鲸，内德·兰德想捕杀却被尼摩艇长制止，认为人类不应滥杀无害动物。不久，长须鲸的天敌抹香鲸群出现，鹦鹉螺号为了保护长须鲸，猛烈攻击抹香鲸群。随后，潜艇开往终年冰雪覆盖的南极圈，冲破巨大的冰盖浮出水面。
潜艇进入红海，尼摩艇长解释了红海得名的原因，并展示了他发现的连接红海与地中海的地下通道“阿拉伯隧道”。穿过隧道时，内德·兰德又用捕鲸叉击杀了儒艮。随后潜艇抵达希腊群岛附近，目睹了海底火山喷发的奇观，尼摩艇长还向一名潜水员赠送了大量黄金。
在锡兰岛的采珠场，尼摩艇长展示了原始的采珠方式和采珠人的悲惨生活。观看过程中，一名采珠人遭到巨型鲨鱼的袭击，尼摩艇长舍身相救并与鲨鱼搏斗。千钧一发之际，内德·兰德用鱼叉刺中鲨鱼要害，救了艇长。艇长为表达谢意，赠送了采珠人一袋珍贵的珍珠。
潜艇沿南美洲海岸北上，在亚马逊河口用印颈鱼钓海龟。在留卡斯群岛附近，潜艇被一群大章鱼缠住螺旋桨，动弹不得。艇顶平台上发生了人与章鱼的生死搏斗，尼摩艇长救下了差点丧命的内德·兰德。随后，艇长为牺牲的船员哀悼，并扔下装有研究总结的海中容器。
潜艇背离欧洲驶向大西洋深处，尼摩艇长带教授夜探三百米深的海底，参观了传说中的亚特兰蒂斯古城。之后，他们在一个熄灭的火山中心获取燃料。在马尾藻海，潜艇下潜至一万六千米深却安然无恙，展现了其卓越的耐压性能。
潜艇继续深入太平洋深处，下潜至四千米，沿途景象令人震撼。他们看到一艘沉船的凄惨遗迹，也见证了瓦尼可罗群岛海底遗物背后两艘法国探险船失踪的历史真相。随后，潜艇穿越了危险的托雷斯海峡，期间不幸触礁搁浅，三人得以登上格波罗阿尔岛休整，采摘野果并捕捉了一只被迷醉的极乐鸟。
故事始于1866年，海上出现了一个神秘的庞然大物，导致多艘船只莫名被撞坏。公众对此恐慌不已，强烈要求清除这个所谓的“怪物”。面对这一危机，法国巴黎自然史博物馆的阿罗纳克斯教授经过分析，认为这很可能是一种力量惊人的独角鲸，于是应邀登上了美国海军部组织的“亚伯拉罕·林肯”号驱逐舰，准备参与清除行动。
教授再次提出离艇要求被拒。在暴风雨中，尼摩艇长屹立于艇顶岿然不动。随后，他潜入海底凭吊“复仇者号”战舰，并在一场冲突中击沉了另一艘攻击他的战舰，从中获得复仇的快感。最终，在潜艇卷入大旋流之际，教授三人利用小艇成功逃离。
三人被拖入潜水艇后关进黑屋子，随后由一名说法语的神秘人出现。此人正是鹦鹉螺号潜艇的尼摩艇长，他自称“不存在的人”。尼摩艇长表示沉默是为了观察他们，并强硬要求三人听从命令，否则处死。他宣称自己依赖海洋生存，认为海洋中没有争斗和独裁，以此表明其对抗陆地文明的态度。
教授跟随尼摩艇长登上南极大陆，领略了极地的独特美景。然而，在离开南极时，潜艇不幸被倒下的冰块困住，四周形成厚实的冰墙，导致艇内极度缺氧。尼摩艇长冷静指挥大家轮班开凿冰墙并喷射开水防冻，最终全员协力冲破冰原，重获自由。